Oui, « je fais la navette de Wieliczka à Cracovie pour travailler » est correct puisque tu fais régulièrement ce trajet (aller et retour) plusieurs fois par semaine ou plusieurs fois par mois. Ce qui est important pour utiliser cette expression c’est :
1) faire le chemin dans un sens puis dans l’autre
2) faire plusieurs fois cet aller et retour sur une période donnée (la journée, la semaine, le mois ou voire l’année)